江苏省中医院刘沈林工作室的口述记录里提到，东垣和叶天士这两位古代名医的思想，加上吴门孟河的传承，为他打下了扎实的学术根基。徐景藩教授曾是他的老师，刘沈林跟随他钻研脾胃与消化道肿瘤的诊治方法已有几十年。李东垣曾说过，很多疾病都是因为脾胃受伤引起的，所以他在治疗时多用温补和升阳的方法。叶天士则提出要分别治疗脾胃，主张用甘凉滋润的方法养胃阴。刘师在看病时，不喜欢用大寒大苦的药，喜欢用甘凉滋润的药来治疗胃阴不足引起的胃痛和嘈杂症状。他认为脾胃是全身的濡养者，五脏六腑都以胃气为本。不管是外感还是内伤的疾病，其转归都与脾胃密切相关。只要有胃气就能够生存下去，没有了胃气就会有危险。肿瘤晚期的时候尤其要注意保护胃阴和脾阳。刘沈林教授主张结合现代影像、内镜和基因检测等手段来进行三维辨治。他会把微观指标纳入宏观辨证中去进行四诊升级。在治疗层面上，他会区分“病”、“证”、“症”三层来进行管理。根据不同体质制定不同的治疗方案，根据不同情况进行辨证施治。刘沈林教授把体质分成寒、热、虚、实、瘀、湿六维坐标来进行评估和调整。对于不同阶段的肿瘤患者，他会制定不同的治疗策略：癌前病变期注重阻断癌变并调气活血；可手术期注重防复发转移并健脾益肾；不可手术或晚期则注重延长生存时间和减轻痛苦，主要用和胃降逆和益气养阴的方法。 刘沈林强调用药要精炼灵动而不呆滞。他喜欢用参苓白术散来健脾，以太子参、淮山药、炒扁豆、莲肉等四君子坐镇。对于胃阴不足的人他会加白芍和甘草酸甘化阴；对于运力不足的人他会加神曲和谷芽；对于气滞不舒的人他会用佛手和枳壳理气而不伤阴。他常配合使用“升降对”、“辛开苦降”，如黄连配吴萸、桔梗配枳壳、白术配鸡内金，使药方灵动而不呆滞。每方都会加砂仁、陈皮以保证补而不滞。 刘沈林把经典乌梅丸活化成“乌梅法”，主要用乌梅和五味子。动物实验显示这个方法能够抑制MMPs、VEGF、CXCR4的表达，延长荷瘤鼠的生存时间。临床观察也表明这个方法能缩小瘤体并降低复发率。刘沈林总结说乌梅养阴柔肝而五味敛肺生津二者合起来是抗转移的双重利器。 刘沈林坚持临床与基础研究相结合：临床发现问题后翻阅明清医案寻找线索然后设计实验验证机制最后将新药转化回临床这个闭环让他把经验上升成规律也让古方在实验室里获得新生。